드디어 닌자들은 마스터 우를 통해 크럭스와 아크로닉스에 대한 진실을 알게 됐다. 둘은 시곗바늘 형제라는 별명으로 불리던, 타락한 두 명의 시간의 원소 마스터였다. 그러나, 다시 돌아온 아크로닉스가 마스터 우와 40년 전 끝내지 못한 결투를 마무리하고 사라졌기 때문에, 더 이상 걱정할 일이 없다. 그러나 마스터 우는 결투 중, 아크로닉스의 시간의 펀치를 맞고 힘겨워한다. 한편, 닌자들은 새로운 적, ‘버밀리언 군대’와 만나게 되지만, 이들을 상대할 방법을 찾지 못해 허둥댄다.
